Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L2

Tcf25, Transcription factor 25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf25Q8R3L2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcf25Q8R3L2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcf25Q8R3L2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcf25Q8R3L2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms