Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnaaf4Q8R368 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnaaf4Q8R368 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnaaf4Q8R368 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnaaf4Q8R368 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms