Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf3c5Q8R2T8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf3c5Q8R2T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtf3c5Q8R2T8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gtf3c5Q8R2T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms