Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q5

Chchd7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd7Q8K2Q5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chchd7Q8K2Q5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chchd7Q8K2Q5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd7Q8K2Q5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chchd7Q8K2Q5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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