Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fcho1Q8K285 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Fcho1Q8K285 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcho1Q8K285 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcho1Q8K285 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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