Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trip10Q8CJ53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trip10Q8CJ53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms