Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam20aQ8CID3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam20aQ8CID3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam20aQ8CID3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam20aQ8CID3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms