Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Rftn2Q8CHX7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rftn2Q8CHX7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms