Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rapgef2Q8CHG7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rapgef2Q8CHG7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rapgef2Q8CHG7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rapgef2Q8CHG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms