Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK3

Lonp1, Lon protease homolog, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonp1Q8CGK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lonp1Q8CGK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lonp1Q8CGK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lonp1Q8CGK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms