Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gpc3Q8CFZ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gpc3Q8CFZ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gpc3Q8CFZ4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms