Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc8Q8CFD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ercc8Q8CFD5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ercc8Q8CFD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ercc8Q8CFD5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ercc8Q8CFD5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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