Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
9030612E09RikQ8CE20 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
9030612E09RikQ8CE20 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
9030612E09RikQ8CE20 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms