Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc38Q8CDN8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc38Q8CDN8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms