Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwa8Q8CC88 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwa8Q8CC88 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwa8Q8CC88 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms