Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ephb1Q8CBF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ephb1Q8CBF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ephb1Q8CBF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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