Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tprg1Q8CB49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tprg1Q8CB49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tprg1Q8CB49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tprg1Q8CB49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms