Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vwc2Q8C8N3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vwc2Q8C8N3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms