Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ClmnQ8C5W0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ClmnQ8C5W0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ClmnQ8C5W0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClmnQ8C5W0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms