Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc113Q8C5T8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc113Q8C5T8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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