Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc90bQ8C3X2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms