Protein–RNA interactions for Protein: Q8C341

Suco, SUN domain-containing ossification factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SucoQ8C341 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SucoQ8C341 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SucoQ8C341 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SucoQ8C341 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms