Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gpcpd1Q8C0L9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gpcpd1Q8C0L9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gpcpd1Q8C0L9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms