Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Iffo1Q8BXL9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Iffo1Q8BXL9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Iffo1Q8BXL9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Iffo1Q8BXL9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Iffo1Q8BXL9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms