Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod1Q8BVA4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod1Q8BVA4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmod1Q8BVA4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lmod1Q8BVA4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms