Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUG5

Caps2, Calcyphosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caps2Q8BUG5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Caps2Q8BUG5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Caps2Q8BUG5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Caps2Q8BUG5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms