Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubr7Q8BU04 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubr7Q8BU04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ubr7Q8BU04 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms