Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup54Q8BTS4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup54Q8BTS4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup54Q8BTS4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup54Q8BTS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms