Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PcgF3Q8BTQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcgF3Q8BTQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms