Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lig4Q8BTF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig4Q8BTF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig4Q8BTF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms