Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bicd1Q8BR07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bicd1Q8BR07 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bicd1Q8BR07 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms