Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prune1Q8BIW1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prune1Q8BIW1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prune1Q8BIW1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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