Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbfox3Q8BIF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbfox3Q8BIF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms