Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Bhlhe23Q8BGW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms