Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1l4Q8BGJ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms