Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pld4Q8BG07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pld4Q8BG07 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pld4Q8BG07 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms