Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.2Q85ZW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M10.2Q85ZW9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M10.2Q85ZW9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M10.2Q85ZW9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M10.2Q85ZW9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.1 ms