Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc172Q810N9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc172Q810N9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc172Q810N9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms