Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim19Q80ZU4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim19Q80ZU4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim19Q80ZU4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms