Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Kdm5bQ80Y84 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Kdm5bQ80Y84 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Kdm5bQ80Y84 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm5bQ80Y84 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm5bQ80Y84 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm5bQ80Y84 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm5bQ80Y84 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm5bQ80Y84 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms