Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chn2Q80XD1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chn2Q80XD1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chn2Q80XD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms