Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbed4Q80WQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbed4Q80WQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zbed4Q80WQ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms