Protein–RNA interactions for Protein: Q80W54

Zmpste24, CAAX prenyl protease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmpste24Q80W54 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmpste24Q80W54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zmpste24Q80W54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zmpste24Q80W54 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms