Protein–RNA interactions for Protein: Q80VA5

Sh3tc2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc2Q80VA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3tc2Q80VA5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh3tc2Q80VA5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh3tc2Q80VA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms