Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rab3gap1Q80UJ7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rab3gap1Q80UJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms