Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdccag8Q80UF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdccag8Q80UF4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdccag8Q80UF4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms