Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rpap1Q80TE0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rpap1Q80TE0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rpap1Q80TE0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rpap1Q80TE0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms