Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mcph1Q7TT79 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mcph1Q7TT79 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mcph1Q7TT79 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mcph1Q7TT79 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms