Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf7ipQ7TT18 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf7ipQ7TT18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atf7ipQ7TT18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atf7ipQ7TT18 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms