Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnf1Q7TSH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnf1Q7TSH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnf1Q7TSH7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms